centos6.5安装R语言出现问题怎么解决

这篇文章主要讲解了“centos6.5安装R语言出现问题怎么解决”，文中的讲解内容简单清晰，易于学习与理解，下面请大家跟着小编的思路慢慢深入，一起来研究和学习“centos6.5安装R语言出现问题怎么解决”吧！

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环境：虚拟机centos6.5 内核为2.6.32-696.1.1.el6.x86_64(这是更新后的内核版本，没更新之前比这个版本低)、R-3.3.2

在网上大多攻略都是先下载R压缩包，然后解压，配置安装，步骤如下：

(1)下载安装包

wget https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.2.2.tar.gz

(2)解决依赖包

#yum install gcc-gfortran

#yum install gcc gcc-c++

#yum install readline-devel

#yum install libXt-devel

(3)解压安装

# tar xvf R-3.3.2.tar.gz

# cd R-3.3.2

# ./configure

# make

# make install

在进行make时，报错make: *** No targets specified and no makefile found. Stop.

这就尴尬了，知道问题来了，找度娘，找到一篇博文，说两个原因，一个是内核太旧，一个是依赖包没装全，就先更新个内核

yum update

更新到一半断掉了，那么问题又来了，重新启动时报错vfs:unable to mount root fs on unknown-block(0,0)

又找度娘，发现是升级时没更新完全，grub引导文件有问题，就到/boot/grub/menu.lst查看，发现最新版本启动命令中缺少initrd，可是天生愚钝，搞不清这个东西是怎么生成的，搞了好久也没搞好，无奈，只能卸掉内核重新更新；

yum remove kernel 2.6.32-696.1.1.el6.x86_64

卸载完后，重新yum update，完美升级！删除掉旧内核，升级算是解决了。

然后再解压安装，还是报错，那就是依赖包没装完全，在执行./configure过程中其实就是在检查依赖包，第一次安装时没太注意，后来发现这样一段

checking for zlib.h... yes

checking if zlib version >= 1.2.5... no

checking whether zlib support suffices... configure: error: zlib library and hea     ders are required

再查看内核的zlib

rpm -qa | gerp zlib

发现内核自带zlib是1.2.3版本的，可见版本太低造成的，问题确定了，接着度娘，找到一篇博客https://www.hitoy.org/use-the-compiled-zlib-library-to-replace-the-system-integration-one.html

说是要先升级zlib，我想这先卸载，再升级，可是系统不让卸载，后来才发现zlib是内核中很重要的部分，依赖非常多，所以不能卸载；那就直接升级吧，yum install zlib，却告诉我系统已经安装，无奈自己在网上下载个，按照上面博客的说法做下去，最后安装时依旧是找不到zlib！

这个问题纠结了我两天，没办法换zlib版本，在网上重新下载了个zlib-1.2.5版的

./configure

make

make install

上述问题看样子是现有内核版本不支持最新版zlib，所以还是用个低版本的！！

再安装R又报错bzip2版本太低，要求要大于等于bzip2-1.0.6，内核自带版本是bzip2-1.0.5，网上下载，安装，接着报错

/usr/bin/ld: blocksort.o: relocation R_X86_64_32 against `.rodata.str1.1' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC

blocksort.o: could not read symbols: Bad value

collect2: ld returned 1 exit status

make: *** [all] Error 1

无奈，接着找度娘，需要修改Makefile-libbz2_so中的CC=gcc 为CC=gcc -fPIC，并且解压文件中没有configure，需要先执行 make -f Makefile-libbz2_so，然后在make install；

再次安装R，问题依旧，这就尴尬了，各种百度，都没有解决，问题只能是定位到系统内核本身了，就像第一次安装zlib-1.2.11版本系统不识别一样，看来是系统不兼容bzip2-1.0.6版本，所以这种自己动手安装的办法不可行了，抛弃！

最后百度了一个只需要三个步骤的方法，大体是说，先更新系统内核，利用第三方yum源epel，其中包含了最新的各种软件包，之后就像安装软件一样利用yum安装R，是成功的，步骤如下：

su -c "rpm -Uvh http://download.fedoraproject.org/pub/epel/6/i386/epel-release-6-8.noarch.rpm"

yum update

yum install R

附图如下：

下载yum源

更新yum源

安装R过程