一、 安装RODBC库
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1、进入R语言的GUI界面(RGUI.EXE),在菜单栏选择“程序包/安装程序包
2、在弹出的窗口里往下拉,选择RODBC如图,点击确定
3、在ODBC数据源管理器里将需要的数据库添加进去,这里笔者使用的是SQL Server2008,驱动程序选择Native Client10.0
3、在R语言窗口输入连接语句
library(RODBC)
**这里是载入RODBC库
channel-odbcConnect("MyTest",uid="ripley",case="tolower")
**连接刚才添加进数据源的“MyTest”数据库
**ch - odbcConnect("some dsn ", uid = "user ", pwd = "**** ")
**表示用户名为user,密码是****,如果没有设置,可以直接忽略
data(USArrests)
**将“USArrests”表写进数据库里(这个表是R自带的)
sqlSave(channel,USArrests,rownames = "state",addPK = TRUE)
**将数据流保存,这时候打开SQL Server就可以看到新建的USArrests表了
rm(USArrests)
sqlTables(channel)
**给出数据库中的表
sqlFetch(channel,"USArrests",rownames = "state")
**输出USArrests表中的内容
sqlQuery(channel,"select * from USArrests")
**调用SELECT查询语句并返回结果(如图)
sqlDrop(channel,"USArrests")
**删除表
odbcClose(channel)
**最后要记得关闭连接
当然,通过这个办法也可以读取Excel、Access表中的内容,具体方法类似,这里不再重复
一些常用的数据,处理好,放在mySQL里,以后使用起来也方便。
可以用R直接进行分析,具体步骤如下:
1、R下载RODBC包,安装好。
下载mySQL ODBC,安装好。
3、windows:控制面板-管理工具-数据源(ODBC)-双击-添加-选中mysql ODBC driver一项
填写:data source name 一项填入你要使用的名字,自己随便命名,例如:mysql_data;
description一项随意填写,例如mydata
TCP/IP Server 填写本机服务器IP,一般为:127.0.0.1
user 填写你的mysql用户名
password 填写你的mysql密码
然后数据库里会出现你的mysql里的所有数据库,选择一个数据库。
确定。
4、打开R的界面调用数据库:
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library(RODBC); channel - odbcConnect("mysql_data", uid="root",pwd="123"); sqlTables(channel);#查看数据中的表 data-sqlFetch(channel,"kegg")# 查看表的内容,存到数据框里
下载“R语言软件”,安装后就可以打开了,打开方式是直接将此文件拖到R语言软件的运行快捷方式图标后松开,或者打开R语言软件后添加打开该文件~
、使用R数据库接口
连接MySQL,使用RMySQL包,使用前RMySQL包要先安装。
library(RMySQL)
连接方式有2种:
(1)使用dbConnect
conn - dbConnect(MySQL(), dbname = "rmysql", username="rmysql", password="rmysql", host="127.0.0.1", port=3306)
数据操作方法:
dbWriteTable(conn, "tablename", data) #写表