(自己)常用的文本文件的行处理命令
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示例文件:test.vcf
1、head -n 10 test.vcf
head : 默认是提取文件的前10行,-n 参数可以设定选择文件的前n行
2、tial -n 10 test.vcf
tail : 默认是提取文件的末尾10行, -n 参数可以设定选择文件末尾的n行
3、sed -n '10,20p' test.vcf
sed -n : 随意选择需要查看的行
sed命令是一个面向行处理的编辑器,可以和正则表达式配合使用,附上较全面的sed命令使用教程。
4、awk 截取行的指定长度字符串
less test.gz |awk '{if(NR%2==1){print}else{print substr($1,1,75)}}' | gzip -c test.part.gz
说明:对test.gz文件指定行截取75bp,原来是150bp
5、对n行的第三列求和,求平均值
grep -v ‘#’ test.vcf |sed -n '20,35p' |awk -F '\t' '{sum+=$3;n++}END{print sum,sum/n}'
(linux 一行命令计算速度比Python快,简单计算喜欢用linux命令)
记得随时整理使用过的命令,没学过linux,靠着各种帖子,随时需要随时补给,有点懒。
1、在linux中的复制粘贴命令:在一行的任何位置按下yy,y是yanked拷贝的意思,然后去想粘贴的位置按下p即可。p是粘贴的意思。
2、如果想复制3行的话,按下3yy,就复制3行,如果想复制多行的话,直接按数字可以选中多好,然后粘贴。
3、剪切和粘贴:把光标移动到想剪切那一行的任意位置,按dd。后在想粘贴的位置按下p粘贴。
4、按下数字如3dd,剪切3行,然后去想粘贴的地方粘贴即可。
5、删除上面最后一行中的数字6,首先按下Ctrl+v,进入Visual Block模式(块选择模式),这是一种特殊的模式,允许选择多个字符。
1. 如果你只想看文件的前100行,可以使用head命令,如
head -100 filename
2. 如果你想查看文件的后100行,可以使用tail命令,如:
tail -100 filename 或 tail -n 100 filename
3. 查看文件中间一段,你可以使用sed命令,如:
sed -n '100,200p' filename
这样你就可以只查看文件的第100行到第200行。
截取的文件可以用重定向输入到新的文件中:
head -100 filename a.txt
也可以在robot里面使用read 打印出来
使用命令:
ps -aux | grep tomcat/8080
方法二:直接使用 netstat -anp | grep portno
即:netstat –anp | grep 8080
查看端口命令
linux替换目录下所有文件中的某字符串
比如,要将目录/modules下面所有文件中的zhangsan都修改成lisi,这样做:
sed -i "s/zhangsan/lisi/g" `grep zhangsan -rl /modules`
解释一下:
-i 表示inplace edit,就地修改文件
-r 表示搜索子目录
-l 表示输出匹配的文件名
linux查找目录下的所有文件中是否含有某个字符串
查找目录下的所有文件中是否含有某个字符串
find .|xargs grep -ri "php"
查找目录下的所有文件中是否含有某个字符串,并且只打印出文件名
find .|xargs grep -ri "php" -l
ip addr 查看ip地址