比BLAST快的多的蛋白序列比对工具RAPSearch2是怎样的，很多新手对此不是很清楚，为了帮助大家解决这个难题，下面小编将为大家详细讲解，有这方面需求的人可以来学习下，希望你能有所收获。
创新互联建站是一家专注于网站建设、成都做网站与策划设计,清水网站建设哪家好?创新互联建站做网站,专注于网站建设十载,网设计领域的专业建站公司;建站业务涵盖:清水等地区。清水做网站价格咨询:18982081108
下面介绍一个软件，2012年发表在Bioinformatics上，目前引用接近300次。
我是在一篇数据库文献里看到了这个工具。
BLAST是非常经典的比对算法，后来出现的BLAT速度能比BLAST快100倍，但是对于非常相似的序列比对，结果会丢失一部分(>20%)相似性较低的结果。RAPSearch是用于短蛋白序列相似性比对的工具，速度比BLAST快~20-90倍。但是内存占用比较大。RAPSearch结果丢失的比例<5%。
作者再次基础上又推出了RAPSearch3，内存占用较小，且速度比之前又快了2~3倍。单线程运算需要2G内存，4线程运算需要3.5G内存。
看完上述内容是否对您有帮助呢？如果还想对相关知识有进一步的了解或阅读更多相关文章，请关注创新互联行业资讯频道，感谢您对创新互联的支持。
分享名称：比BLAST快的多的蛋白序列比对工具RAPSearch2是怎样的
网页地址：
http://cdkjz.cn/article/gehgec.html
