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最近有粉丝反映说,利用clusterProfiler这个包绘制GO富集分析气泡图和柱形图的时候,发现GO条目的名字都重叠在一起了。气泡图 柱形图 这个图别说美观了,简直不忍直视。经过我的认真研究,发现跟R版本有关。
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但是该方法存在一个很大的问题,那就是当x轴标签数量很多时,那么就无法通过这样的方法进行解决了。方法二是方法一的逆向思路,既然可以调大画布,那么反过来,我们也可以调小x轴标签字体。
最近小Q在做自然选择分析,分析完之后简单粗暴的对候选基因做了富集分析,并做了展示,比起气泡图,我模仿了另一种作图方式,显示效果更佳。所以想在此分享一下如何用R语言画富集分析示意图(非气泡图)。
在是否需要构建的问题上,我看到徐洲更在 功能注释后如何做富集分析 中提到 “你不需要构建Orgdb,因为Orgdb的用途是进行基因编号和GO/KEGG的转换。
单细胞富集分析我最常用的是 分组GSVA ,但最近用到了GO分析,就复习一下GO和KEGG富集分析及绘图。载入无比熟悉的pbmc.3k数据集 (已注释好,数据准备见 monocle )pbmc3k数据集只有1个样本,没办法区分HC和病例组。
1、(注:你系统内的汇编程序为MASM.EXE,如果你系统的汇编程序为ASM.EXE时,便将命令变为ASM filename回车。
2、一般汇编语言是在masm下编辑的,生成exe执行文件,没什么很高要求。
3、不需要特别的软件环境,只需要手头有一个汇编语言编译器和一个文本编辑器就够了。文本编辑器推荐使用masm, editplus之类的,可以高亮代码中的关键字,当然如果你愿意用记事本也行。
4、可以搜下集成汇编环境啊,像“轻松汇编”,辰灿汇编语言集成开发环境, MasmEditor这些。集成环境里面汇编调试这些都比较方便。 下面这个操作非常简单。
一个工程就是就是一个C程序,工程虽然可以包含多个程序文件,但不可以编译多个C程序。编译器是在编译阶段分别编译工程内的多个文件,最后将编译各个文件得到的多个obj目标文件链接到一起成为一个可执行程序。
name :要打开的文件名 flag :打开文件的模式。 模式有以下几种:perm :文件权限,一个八进制数。r(读)04,w(写)02,x(执行)01。
Go 命令在go.work文件指定的hello目录中查找命令行中指定的example点抗 /hello模块 ,同样使用go.work文件解析导入golang.org/x/example。go.work可以用来代替添加replace 指令以跨多个模块工作。
下载并安装goclipse插件。Goclipse是go语言for eclipse的插件,下载地址:http://code.google点抗 /p/goclipse/ 启动eclipse并创建go项目。然后写个最简单的helloworld.go文件,并运行。
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